尽管人工湿地系统有着低耗高效、技术含量要求低的种种优点。但其不足之处也是十分明显的。首先，湿地系统的出水水质在很大程度上受到环境因索的影响。在当前对出水水质要求更加严格的形势下.如何做到在不断变化的外部环境因未下，有效地控制湿地系统的运行从而取得稳定达标的出水这一问题待解决。另外，湿地系统在处理难降解废水时能力显得不足，出水水质较差，如何改进工艺从而尽可能地提高其净化能力也是目前面临的研究课题。　　

　　针对上面的问题，研究人员对人工湿地系统进行了进一步的研究，目前已取得了许多新进展，并提出了工程湿地(engineered wetland)的概念。工程湿地属于人工湿地的概念范畴.但又对人工很地作了许多改进。在上程湿地系统中.

　　可以根据不断变化的气候环境和不同的入流水质.有意识地改变湿地系统的运行参数和运行方式.从而实现对湿地系统的操控.以达到出水水质稳定的目的。比如，可以控制入流的流速，或者根据水质情况设置循环，使含有某一污染物的污水在湿地的某一特定区城被循环处理.以充分利用这一区域的特定净化能力。另外，填充对某污染物具有特定吸附能力的衬层也是有效的选择。在必要的情况下，也可以使用加热、添加化学物质或曝气等非常规方法;而在种植植物方面，应该选择具有相应生物修复能力的植物。工程湿地还可以同其他处理工艺结合起来，从而降低各自的负荷提高系统总的净化能力。

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