离子交换系统是通过阴阳离子树脂对水中的阴阳离子进行置换的处理工艺，离子交换设备中的阴阳离子交换树脂按照不同的比例进行搭配，组成离子交换阳床系统、离子交换阴床系统和离子混床系统三种。混床系统是在反渗透处理工艺后用来制取超纯水。离子交换设备采用离子交换方法，把水中的阴阳离子清除，用氯化钠代表水中无机盐类，水质除盐的基本反应方程式如下：

　　阳离子交换树脂：R—H+Na+ R—Na+H+

　　阴离子交换树脂：R—OH+Cl- R—Cl+OH-

　　阳、阴离子交换树脂总的反应式为：

　　RH+ROH+NaCl——RNa+RCL+H2O

　　从而看出，水中的氯化钠已分别被树脂上的氢离子和氢氧根离子所取代，生成水，达到清除水中盐的作用。