在安装完工业反渗透纯水设备之后，要先打开水龙头管路上的电镀球阀，并且关闭反冲球阀，然后将压力桶球阀打开；将变压器电线插头插入到电源插座中，此时泵浦就会开始启动，此时的反渗透设备也就开始工作制水。
      当反渗透设备开始工作后，要对排出的初滤水进行检查。制水时，过滤后的纯水会进入到压力桶中，除此之外，逆渗透膜管的初滤水经过废水比例器管路排出。打开反冲球阀，检查是否有较多的初滤水排除后再将其进行关闭。
      使用反渗透纯水设备制备纯水需要较长的时间才可以将压力桶填满，为了快速确知其动作，需要在5分钟后将压力桶球阀关闭，此时管线内的压力将会增高到一定的值，高压开关应起跳而使高压泵停止运转。然后打开鹅颈龙头进行放水，高压泵应自动开始启动进行运转。如此反复动作几次之后，检查高压泵是否会自动启动和停止。确认动作正常之后，打开压力桶球阀。
      将自来水管路上的电镀球阀关闭，表示预设无水或缺水时状态，则低压开关应动作而使高压泵自动停止，以防止高压泵无水空转而损坏。试动作正常后，再打开水源管路上的电镀球阀。 试运转 5~10 分钟后，关闭压力桶球阀，高压泵自动停止后，检查是否有水从初滤水排出管连续不停流出。如有流出的情形，表示四面阀或逆止阀有故障，应更换或排除故障。
      在反渗透设备的运转过程中，自动启动和停止之后，应对所有的零件、组件、接头处进行检查，看是否存在有漏水的现象。当一切都正常之后，使得反渗透设备运行制水，检查水龙头的水质是否已经达到标准。完成安装以及调试之后，让反渗透纯水设备正常的运转十分钟左右，再将水龙头打开，将初期所造之水完全流掉，使得压力桶得到清洗，然后再将水龙头关闭，此后再使用的水便是甘甜可口的安全饮用水了。